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我國構建了人群腸道微生物菌株資源庫 探測到“暗物種”

來源:中國科學報

日,中國科學院微生物所研究員劉雙江團隊構建了包含400個不同物種的健康人群腸道微生物菌株資源庫(hGMB)。相關成果發(fā)表于《微生物組》。

此次構建的hGMB包括400個不同的物種,其中有102個物種為首次分離、培養(yǎng)和鑒定,1170株代表菌株保存在中國普通微生物菌種保藏中心,已經向科研界和產業(yè)界提供了數次菌株服務,支持腸道微生物功能開發(fā)和微生物—宿主互作研究。為了充分發(fā)揮和挖掘菌株資源的價值,該資源庫物種信息已在相關網站公布。

據介紹,hGMB的構建歷時兩年,研究團隊從239例來自不同地區(qū)、不同年齡體檢健康人群的新鮮糞便樣品中挑取超過2萬個單克隆,擴大培養(yǎng)后從中鑒定出超過1萬個純培養(yǎng)分離株。通過對健康人腸道宏基因組分析,發(fā)現該菌株資源庫中的85個新物種出現在超過90%健康人腸道中,同時覆蓋79%人腸道已知常見屬和75%常見物種。

與目前最大的人腸道基因組數據庫(UHGG)對比,hGMB貢獻了24個在腸道免培養(yǎng)組學研究中未被探測到卻普遍存在的“暗物種”。

作者表示,鑒于腸道微生物菌株資源庫的建設是開發(fā)利用腸道微生物的基礎,是認知宿主—微生物互作機制中至關重要的一環(huán),構建中華腸道微生物資源庫具有長遠的戰(zhàn)略意義和經濟社會價值。

去年,該團隊還發(fā)表了迄今為止最大的模式動物小鼠腸道微生物資源庫(mGMB),包含126種微生物及其基因組,其中77種微生物是首次成功分離培養(yǎng)的新物種,使得可培養(yǎng)的小鼠腸道微生物菌株資源從48個屬增加到110個屬、從76種增加到180種,且在此過程中形成了一套厭氧微生物分離培養(yǎng)與物種鑒定描述的標準化流程。

標簽: 我國 人群腸道 微生物 菌株 資源庫 暗物種

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